Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms