Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MCRIP1C9JLW8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms