Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A8MVJ9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A8MVJ9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A8MVJ9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A8MVJ9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A8MVJ9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms