Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms