Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms