Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR1DQ9Y2S0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms