Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms