Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms