Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCG2Q9UNQ0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms