Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2A1LQ9UNN4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2A1LQ9UNN4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms