Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms