Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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USP18Q9UMW8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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USP18Q9UMW8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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