Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF11Q9UIL8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms