Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms