Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms