Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHORDC1Q9UHD1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms