Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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