Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLKQ9UBT6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms