Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms