Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms