Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20BQ9P0W2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms