Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms