Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms