Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ELL3Q9HB65 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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