Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms