Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAPERQ9BY12 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms