Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms