Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HIGD2AQ9BW72 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms