Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms