Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NDFIP1Q9BT67 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms