Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms