Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SGIP1Q9BQI5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms