Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms