Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNS3Q9BQ31 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms