Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms