Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA3CQ99985 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms