Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORT1Q99523 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms