Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2BQ99453 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms