Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIN3AQ96ST3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms