Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCNX1Q96RV3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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