Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
UBE2E2Q96LR5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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UBE2E2Q96LR5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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UBE2E2Q96LR5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
UBE2E2Q96LR5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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