Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGF29Q96ES7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms