Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT1Q96EB6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms