Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.125e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 DHRS12-204ENST00000461948 487 ntTSL 37.92□□□□□ -1.145e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.174e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RGS5-210ENST00000531954 581 ntTSL 47.69□□□□□ -1.185e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.185e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.185e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 IGF2BP3-208ENST00000469723 556 ntTSL 57.66□□□□□ -1.185e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ROBO1-206ENST00000484514 3236 ntTSL 27.52□□□□□ -1.215e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.215e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-220ENST00000569766 3555 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.215e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 DHRS12-207ENST00000489680 393 ntTSL 57.32□□□□□ -1.245e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.255e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RGS5-213ENST00000427213 616 ntTSL 37.22□□□□□ -1.255e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.255e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RGS5-211ENST00000534288 591 ntTSL 47.22□□□□□ -1.255e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ALG5-205ENST00000496689 756 ntTSL 57.15□□□□□ -1.265e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-207ENST00000549350 3588 ntTSL 27.05□□□□□ -1.285e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.35e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.335e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RGS5-207ENST00000530241 576 ntTSL 36.57□□□□□ -1.365e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-216ENST00000566301 3840 ntTSL 1 (best)6.52□□□□□ -1.375e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-212ENST00000563288 3790 ntTSL 1 (best)6.5□□□□□ -1.375e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-211ENST00000562926 3748 ntTSL 1 (best)6.27□□□□□ -1.415e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SESTD1-209ENST00000489901 652 ntTSL 26.2□□□□□ -1.425e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 CHD2-221ENST00000635856 4236 ntTSL 56.15□□□□□ -1.425e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.445e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.455e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-205ENST00000535127 4194 ntTSL 1 (best)5.93□□□□□ -1.465e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.475e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FKBP1A-208ENST00000474726 551 ntTSL 35.81□□□□□ -1.485e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 CMTR1-206ENST00000493656 550 ntTSL 55.69□□□□□ -1.55e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SENP2-212ENST00000478001 541 ntTSL 45.68□□□□□ -1.55e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-218ENST00000567152 3186 ntTSL 1 (best)5.57□□□□□ -1.525e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-221ENST00000570212 3181 ntTSL 1 (best)5.44□□□□□ -1.545e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MREG-204ENST00000439791 576 ntTSL 45.36□□□□□ -1.555e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.585e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 IGF2BP3-209ENST00000474105 663 ntTSL 45.18□□□□□ -1.585e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RGS5-203ENST00000428971 580 ntTSL 55.06□□□□□ -1.65e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 PCID2-211ENST00000475433 776 ntTSL 54.99□□□□□ -1.615e-7■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.625e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.635e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.635e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.675e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.695e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MREG-203ENST00000424992 560 ntTSL 54.16□□□□□ -1.745e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.755e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.765e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.765e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.785e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MREG-202ENST00000420348 584 ntTSL 43.88□□□□□ -1.795e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-214ENST00000563796 3753 ntTSL 1 (best)3.87□□□□□ -1.795e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FBXL21-205ENST00000478939 1479 ntTSL 1 (best)3.79□□□□□ -1.85e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.875e-7■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 PCID2-212ENST00000480971 701 ntTSL 52.86□□□□□ -1.955e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.965e-6■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.085e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 PUS7L-208ENST00000553166 1149 ntTSL 1 (best)1.85□□□□□ -2.115e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 PUS7L-206ENST00000550784 677 ntTSL 41.76□□□□□ -2.135e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.693e-6■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.542e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 GTF3C1-211ENST00000569653 897 ntTSL 213.31□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 23.4
TBRG4Q969Z0 FUBP1-204ENST00000421641 802 ntTSL 512.37□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 23.4
TBRG4Q969Z0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.965e-6■■■■□ 23.4
TBRG4Q969Z0 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.195e-6■■■■□ 23.4
TBRG4Q969Z0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.017e-7■■■■□ 23.4
TBRG4Q969Z0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.373e-6■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.32e-8■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 RPS29-207ENST00000557367 499 ntTSL 213.05□□□□□ -0.322e-8■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.162e-8■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.362e-8■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.722e-7■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.615e-7■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.545e-7■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-7■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 ASXL1-204ENST00000470145 1073 ntTSL 59.95□□□□□ -0.825e-7■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 512.76□□□□□ -0.375e-7■■■■□ 23.3
TBRG4Q969Z0 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 319.88■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 23.2
TBRG4Q969Z0 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 317.94■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 23.2
TBRG4Q969Z0 SEPT9-217ENST00000587237 548 ntTSL 513.91□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 23.2
TBRG4Q969Z0 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 413.83□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 23.2
TBRG4Q969Z0 TMEM14C-202ENST00000466421 472 ntTSL 214.56□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 23.2
TBRG4Q969Z0 TMEM14C-203ENST00000467415 899 ntTSL 314.21□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 23.2
TBRG4Q969Z0 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 23.2
TBRG4Q969Z0 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 23.2
TBRG4Q969Z0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.965e-6■■■■□ 23.2
TBRG4Q969Z0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.55e-6■■■■□ 23.2
TBRG4Q969Z0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.174e-6■■■■□ 23.1
TBRG4Q969Z0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 23.1
TBRG4Q969Z0 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 23.1
TBRG4Q969Z0 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 23.1
TBRG4Q969Z0 KANSL1-203ENST00000571698 2276 ntTSL 515.22■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 23
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