Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HGDQ93099 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HGDQ93099 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms