Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM41Q8WV44 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms