Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FNDC9Q8TBE3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms