Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNIH3Q8TBE1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms