Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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ZNF548Q8NEK5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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ZNF548Q8NEK5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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