Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L2Q8NAA4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms